广东空间代谢组学研究意义

1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示，将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描，并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图，在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像，在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明，AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm，代谢物质量比较大差异为0.001Da，同一物质的检测动态范围高达1000倍。如图1所示，通过AFADESI-MSI可在大鼠脑部检测到一些呈特征性分布有代表性的极性代谢物，其强度范围从0到104甚至到106。空间代谢组学,代谢组数据库。广东空间代谢组学研究意义

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。广东空间代谢组学研究意义蛋白质组学的研究方法。

空间代谢组学：前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异，例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异，表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性，质谱成像过程中存在分子离域，可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项

空间代谢组学：食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升，但存活率仍然很低，目前急需新的工具来提高早期诊断和精确***。脂质代谢紊乱与**的发***展密切相关，大多数脂质以甘油磷脂（GPLs）的形式储存在双分子膜中，基于甘油磷脂具有较稳定的物理化学性质，因此将其作为疾病诊断的生物标志物具有重要意义。质谱成像(MSI)可在几分钟内对冷冻切片组织的**磷脂体量化并进行客观诊断。然而，MSI是否能客观识别原发性食管腺*目前尚不清楚，这是一个重大的挑战，因为该微环境复杂，组织类型的表型相似。鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。

通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m/z：700–1000），发现两组存在***差异，尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短（18个碳或更少）的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势，然后开始减少，但酰基侧链较长的PG含量持续增加（图 5）。MYC失活后，这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明，MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA（图6C）。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度（图6D）。结果显示，MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组分析测序服务。广东空间代谢组学研究意义

鹿明生物空间代谢组学。广东空间代谢组学研究意义

以上结果表明，AFADESI-MSI方法可以直接检测极性代谢产物，并具有高特异性，能呈现其在大脑微区分布的图像。3.在大鼠脑中绘制微区代谢网络图要了解大脑的结构区域发生的复杂代谢过程，不仅应准确表征代谢物，还要研究其相关性。从大鼠脑微区中提取代谢谱进行代谢网络重建。从15个微区提取的MSI数据进行峰挑选和峰对齐（图1F），包括松果体、中脑导水管、脑桥、梨状皮质、延髓、丘脑、纹状体、海马、胼胝体、嗅球、大脑皮层、小脑皮层、穹窿、小脑延髓和丘脑。广东空间代谢组学研究意义

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